MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11 plasmid 1

Total Repeats: 332

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008503	GCAA	2	8	80	87	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_008503	AATAAA	2	12	169	180	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008503	ATTT	2	8	226	233	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008503	TCA	2	6	306	311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008503	CTT	2	6	387	392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008503	GAT	2	6	418	423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326530
7	NC_008503	TTC	2	6	449	454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326530
8	NC_008503	TTGCT	2	10	512	521	0 %	60 %	20 %	20 %	116326530
9	NC_008503	CAT	2	6	601	606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326530
10	NC_008503	TGAAT	2	10	696	705	40 %	40 %	20 %	0 %	116326530
11	NC_008503	ATTT	2	8	715	722	25 %	75 %	0 %	0 %	116326530
12	NC_008503	T	6	6	827	832	0 %	100 %	0 %	0 %	116326530
13	NC_008503	T	6	6	839	844	0 %	100 %	0 %	0 %	116326530
14	NC_008503	ATT	2	6	862	867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326530
15	NC_008503	T	6	6	869	874	0 %	100 %	0 %	0 %	116326530
16	NC_008503	CTTT	2	8	878	885	0 %	75 %	0 %	25 %	116326530
17	NC_008503	T	6	6	937	942	0 %	100 %	0 %	0 %	116326530
18	NC_008503	GGA	2	6	983	988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116326530
19	NC_008503	TTGA	2	8	996	1003	25 %	50 %	25 %	0 %	116326530
20	NC_008503	T	6	6	1044	1049	0 %	100 %	0 %	0 %	116326530
21	NC_008503	TCT	2	6	1091	1096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326530
22	NC_008503	GTA	2	6	1127	1132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326530
23	NC_008503	CTT	2	6	1218	1223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326530
24	NC_008503	T	7	7	1252	1258	0 %	100 %	0 %	0 %	116326530
25	NC_008503	CAT	2	6	1317	1322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326530
26	NC_008503	TCA	2	6	1373	1378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326530
27	NC_008503	TTTA	2	8	1402	1409	25 %	75 %	0 %	0 %	116326530
28	NC_008503	T	7	7	1528	1534	0 %	100 %	0 %	0 %	116326530
29	NC_008503	GTTT	2	8	1554	1561	0 %	75 %	25 %	0 %	116326530
30	NC_008503	T	6	6	1645	1650	0 %	100 %	0 %	0 %	116326530
31	NC_008503	AAAG	2	8	1659	1666	75 %	0 %	25 %	0 %	116326530
32	NC_008503	AAACAA	2	12	1675	1686	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	116326530
33	NC_008503	TGA	2	6	1766	1771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326530
34	NC_008503	CTTA	2	8	1787	1794	25 %	50 %	0 %	25 %	116326531
35	NC_008503	CTA	2	6	1857	1862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326531
36	NC_008503	TTG	2	6	2001	2006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326531
37	NC_008503	CTC	2	6	2098	2103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116326531
38	NC_008503	GTT	2	6	2127	2132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326531
39	NC_008503	T	6	6	2178	2183	0 %	100 %	0 %	0 %	116326531
40	NC_008503	GTTT	2	8	2194	2201	0 %	75 %	25 %	0 %	116326531
41	NC_008503	AGA	2	6	2241	2246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326531
42	NC_008503	CTTC	2	8	2330	2337	0 %	50 %	0 %	50 %	116326531
43	NC_008503	CGA	2	6	2400	2405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326531
44	NC_008503	TTA	2	6	2504	2509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326531
45	NC_008503	GTTT	2	8	2586	2593	0 %	75 %	25 %	0 %	116326531
46	NC_008503	TGA	2	6	2628	2633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326531
47	NC_008503	A	7	7	2654	2660	100 %	0 %	0 %	0 %	116326531
48	NC_008503	AGG	2	6	2663	2668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116326531
49	NC_008503	TGA	2	6	2679	2684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326531
50	NC_008503	TTG	2	6	2779	2784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326531
51	NC_008503	TCT	2	6	2948	2953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326531
52	NC_008503	GGA	2	6	3009	3014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116326531
53	NC_008503	GTAA	2	8	3023	3030	50 %	25 %	25 %	0 %	116326531
54	NC_008503	CTA	2	6	3066	3071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326531
55	NC_008503	AAT	2	6	3127	3132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326531
56	NC_008503	AAT	2	6	3157	3162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326531
57	NC_008503	TTG	2	6	3177	3182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326531
58	NC_008503	A	6	6	3184	3189	100 %	0 %	0 %	0 %	116326531
59	NC_008503	AAG	2	6	3316	3321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326531
60	NC_008503	ATA	2	6	3391	3396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326531
61	NC_008503	TGA	2	6	3420	3425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326531
62	NC_008503	GAA	2	6	3480	3485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326531
63	NC_008503	GAG	2	6	3544	3549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116326531
64	NC_008503	ACA	2	6	3653	3658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326531
65	NC_008503	ATT	2	6	3733	3738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326531
66	NC_008503	AAT	2	6	3767	3772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326531
67	NC_008503	TAT	2	6	3922	3927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326531
68	NC_008503	T	7	7	3933	3939	0 %	100 %	0 %	0 %	116326531
69	NC_008503	TAA	2	6	3967	3972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008503	TTA	2	6	3983	3988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008503	AATA	2	8	3997	4004	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008503	A	7	7	4004	4010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008503	A	6	6	4013	4018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008503	TTG	2	6	4019	4024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008503	AGAA	2	8	4032	4039	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008503	TTTTTA	2	12	4043	4054	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008503	GCA	2	6	4072	4077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_008503	AAT	2	6	4110	4115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008503	ATTG	2	8	4125	4132	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008503	A	6	6	4133	4138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008503	ATG	2	6	4174	4179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008503	TAT	2	6	4182	4187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008503	GTTA	2	8	4188	4195	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008503	GTT	2	6	4241	4246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008503	A	6	6	4305	4310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008503	A	6	6	4335	4340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008503	TAC	2	6	4373	4378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_008503	A	6	6	4395	4400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008503	T	6	6	4422	4427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008503	ACTA	2	8	4464	4471	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_008503	TGA	2	6	4545	4550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008503	CTA	2	6	4623	4628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_008503	AAT	2	6	4642	4647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008503	AGG	2	6	4661	4666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008503	CAG	2	6	4701	4706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326532
96	NC_008503	ATT	2	6	4713	4718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326532
97	NC_008503	CTA	2	6	4730	4735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326532
98	NC_008503	ACG	2	6	4806	4811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326532
99	NC_008503	ACT	2	6	4841	4846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326532
100	NC_008503	GAAAAA	2	12	4859	4870	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	116326532
101	NC_008503	A	6	6	4872	4877	100 %	0 %	0 %	0 %	116326532
102	NC_008503	ATT	2	6	4933	4938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326532
103	NC_008503	A	6	6	4989	4994	100 %	0 %	0 %	0 %	116326532
104	NC_008503	AC	3	6	4999	5004	50 %	0 %	0 %	50 %	116326532
105	NC_008503	AGC	2	6	5006	5011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326532
106	NC_008503	TGA	2	6	5045	5050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326532
107	NC_008503	AAT	2	6	5160	5165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326532
108	NC_008503	TTGA	2	8	5166	5173	25 %	50 %	25 %	0 %	116326532
109	NC_008503	TA	3	6	5269	5274	50 %	50 %	0 %	0 %	116326532
110	NC_008503	AAG	2	6	5287	5292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326532
111	NC_008503	CT	3	6	5296	5301	0 %	50 %	0 %	50 %	116326532
112	NC_008503	TAT	2	6	5332	5337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326532
113	NC_008503	TTTA	2	8	5383	5390	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008503	CTT	2	6	5408	5413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_008503	TAT	2	6	5414	5419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008503	ATA	2	6	5450	5455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008503	T	6	6	5457	5462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008503	ATC	2	6	5535	5540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_008503	TAT	2	6	5567	5572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008503	GGA	2	6	5575	5580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008503	ATAA	2	8	5586	5593	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008503	T	6	6	5615	5620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008503	ATTT	2	8	5669	5676	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008503	T	7	7	5696	5702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008503	T	8	8	5787	5794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008503	TATT	2	8	5855	5862	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008503	CCT	2	6	5864	5869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_008503	TAA	2	6	5871	5876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008503	TCT	2	6	5903	5908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_008503	TCT	2	6	5942	5947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_008503	T	7	7	5955	5961	0 %	100 %	0 %	0 %	116326533
132	NC_008503	CCA	2	6	5975	5980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116326533
133	NC_008503	T	6	6	5981	5986	0 %	100 %	0 %	0 %	116326533
134	NC_008503	T	6	6	5988	5993	0 %	100 %	0 %	0 %	116326533
135	NC_008503	TTC	2	6	6002	6007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326533
136	NC_008503	TAT	2	6	6013	6018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326533
137	NC_008503	TAT	2	6	6052	6057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326533
138	NC_008503	TCT	2	6	6099	6104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326533
139	NC_008503	TTC	2	6	6110	6115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326533
140	NC_008503	T	6	6	6122	6127	0 %	100 %	0 %	0 %	116326533
141	NC_008503	GTT	2	6	6145	6150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326533
142	NC_008503	T	8	8	6176	6183	0 %	100 %	0 %	0 %	116326533
143	NC_008503	AAAAT	2	10	6214	6223	80 %	20 %	0 %	0 %	116326533
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285	NC_008503	TAT	2	6	11064	11069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326538
286	NC_008503	TCT	2	6	11072	11077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326538
287	NC_008503	GTTT	2	8	11152	11159	0 %	75 %	25 %	0 %	116326538
288	NC_008503	T	8	8	11157	11164	0 %	100 %	0 %	0 %	116326538
289	NC_008503	CAT	2	6	11214	11219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326538
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291	NC_008503	CCT	2	6	11495	11500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
292	NC_008503	ATAA	2	8	11517	11524	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_008503	TAAAA	2	10	11541	11550	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_008503	GTCA	2	8	11820	11827	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
295	NC_008503	A	7	7	11897	11903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_008503	A	6	6	11934	11939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NC_008503	A	7	7	11943	11949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
298	NC_008503	CTT	2	6	11955	11960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
299	NC_008503	A	6	6	11968	11973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
300	NC_008503	AGG	2	6	12089	12094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
301	NC_008503	TAT	2	6	12109	12114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
302	NC_008503	AAAGC	2	10	12182	12191	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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304	NC_008503	T	6	6	12339	12344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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307	NC_008503	TC	3	6	12508	12513	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
308	NC_008503	ATT	2	6	12594	12599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
309	NC_008503	ATA	2	6	12601	12606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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325	NC_008503	TTGA	2	8	13740	13747	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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331	NC_008503	GTT	2	6	13973	13978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
332	NC_008503	TTG	2	6	13984	13989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.